防水军用电连接器要实现防水功能，必须保证对接界面及各分界面能实现密封功能。
防水军用电连接器结构分为插头和插座两部分，通常使用时，插座安装于仪器设备上，通过安装法兰固定，插头结构为电缆形式，可与插座对接实现传输功能。对接端具有一个长方形的橡胶圈，两端设于安装螺纹孔，尾端采用环氧树脂灌封、密封。
安装时，使用两个安装螺钉，采用板后安装方式，插座固定于安装板上，插座上的长方形密封圈在安装螺钉的紧固下压缩，起到密封、防水作用。防水军用电连接器的另一端使用防水线夹固定连接器插头，插头安装在防水线夹内，线夹两端的安装螺钉穿过连接器插头，在防水线夹的对接端设有一个体积较大的密封圈。
当插头与插座对接时，线夹两端的安装螺钉与面板上的六角安装螺钉的内螺纹进行对接，在安装螺钉的作用下，实现连接器插头和插座的插合；同时，防水线夹对接端长方形密封圈受到安装面板的压缩，实现连接器对接界面的密封防水功能。
